Som nevnt innledningsvis er epitelet også utgangspunktet for kroppens kjertler. Dette gjelder alle kroppens kjertler, både de endokrine og de eksokrine kjertlene.
De endokrine kjertlene produserer hormoner. De er uten utførselsgang eller utløpskanal. Dermed vet vi at de skiller ut sine hormoner til omgivelsene. Hormonene blir deretter overført til blodet og transportert rundt i kroppen (omtales nærmere i temaet om endokrinologi).
De eksokrine kjertlene er kjertler med utførselsgang eller utløpskanal. De skiller ut sitt produkt på kroppsoverflater eller i hulrom. Spyttkjertler, svettekjertler og slim- produserende kjertler er eksempler på slike. I tillegg er både leveren og bukspyttkjertelen eksokrine kjertler.